Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL38P63173 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL38P63173 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL38P63173 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL38P63173 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL38P63173 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL38P63173 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL38P63173 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL38P63173 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL38P63173 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL38P63173 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL38P63173 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL38P63173 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL38P63173 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL38P63173 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL38P63173 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL38P63173 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL38P63173 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL38P63173 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL38P63173 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL38P63173 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL38P63173 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL38P63173 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL38P63173 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL38P63173 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL38P63173 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL38P63173 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL38P63173 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL38P63173 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL38P63173 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL38P63173 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL38P63173 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL38P63173 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL38P63173 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL38P63173 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL38P63173 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL38P63173 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL38P63173 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL38P63173 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms