Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRA2BP62995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRA2BP62995 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms