Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2LP62875 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2LP62875 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2LP62875 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms