Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P61574 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P61574 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms