Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V0D1P61421 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V0D1P61421 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V0D1P61421 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms