Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSME3P61289 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSME3P61289 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME3P61289 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME3P61289 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSME3P61289 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME3P61289 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME3P61289 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSME3P61289 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSME3P61289 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME3P61289 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME3P61289 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME3P61289 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME3P61289 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME3P61289 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME3P61289 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME3P61289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME3P61289 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME3P61289 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME3P61289 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME3P61289 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME3P61289 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms