Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STX1BP61266 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STX1BP61266 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1BP61266 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1BP61266 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1BP61266 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1BP61266 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STX1BP61266 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STX1BP61266 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1BP61266 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1BP61266 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1BP61266 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
STX1BP61266 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1BP61266 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1BP61266 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1BP61266 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1BP61266 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1BP61266 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1BP61266 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1BP61266 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX1BP61266 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms