Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TMEM258P61165 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TMEM258P61165 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM258P61165 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM258P61165 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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