Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTBP60709 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBP60709 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBP60709 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBP60709 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBP60709 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBP60709 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBP60709 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBP60709 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBP60709 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBP60709 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBP60709 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBP60709 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBP60709 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms