Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN1P60606 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN1P60606 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN1P60606 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms