Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVPABLB-1P60509 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVPABLB-1P60509 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms