Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPI1P60174 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPI1P60174 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPI1P60174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPI1P60174 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPI1P60174 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TPI1P60174 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPI1P60174 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPI1P60174 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPI1P60174 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPI1P60174 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPI1P60174 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPI1P60174 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPI1P60174 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPI1P60174 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPI1P60174 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPI1P60174 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPI1P60174 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPI1P60174 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPI1P60174 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPI1P60174 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPI1P60174 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPI1P60174 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPI1P60174 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPI1P60174 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPI1P60174 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPI1P60174 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPI1P60174 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPI1P60174 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPI1P60174 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPI1P60174 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPI1P60174 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPI1P60174 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPI1P60174 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPI1P60174 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPI1P60174 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPI1P60174 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPI1P60174 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPI1P60174 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPI1P60174 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPI1P60174 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPI1P60174 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPI1P60174 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPI1P60174 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPI1P60174 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms