Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms