Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX17P56962 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX17P56962 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX17P56962 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX17P56962 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STX17P56962 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STX17P56962 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STX17P56962 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX17P56962 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX17P56962 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX17P56962 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STX17P56962 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX17P56962 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX17P56962 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX17P56962 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX17P56962 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX17P56962 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX17P56962 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX17P56962 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX17P56962 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX17P56962 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX17P56962 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STX17P56962 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX17P56962 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX17P56962 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX17P56962 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX17P56962 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX17P56962 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX17P56962 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX17P56962 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX17P56962 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX17P56962 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX17P56962 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX17P56962 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX17P56962 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX17P56962 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX17P56962 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX17P56962 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX17P56962 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX17P56962 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX17P56962 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX17P56962 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX17P56962 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX17P56962 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX17P56962 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX17P56962 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX17P56962 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX17P56962 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX17P56962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX17P56962 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX17P56962 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX17P56962 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms