Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC13P55735 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC13P55735 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC13P55735 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC13P55735 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC13P55735 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC13P55735 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC13P55735 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC13P55735 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC13P55735 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC13P55735 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC13P55735 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC13P55735 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC13P55735 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC13P55735 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC13P55735 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC13P55735 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC13P55735 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC13P55735 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC13P55735 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC13P55735 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC13P55735 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC13P55735 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC13P55735 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC13P55735 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC13P55735 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC13P55735 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC13P55735 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC13P55735 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC13P55735 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC13P55735 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC13P55735 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC13P55735 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC13P55735 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC13P55735 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms