Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A3P55017 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC12A3P55017 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC12A3P55017 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms