Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC12A2P55011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A2P55011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC12A2P55011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC12A2P55011 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A2P55011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A2P55011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A2P55011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms