Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA2D1P54289 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA2D1P54289 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms