Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRISP3P54108 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRISP3P54108 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms