Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIMK2P53671 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIMK2P53671 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIMK2P53671 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms