Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFIP1P53367 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFIP1P53367 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP1P53367 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms