Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB27AP51159 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB27AP51159 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB27AP51159 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB27AP51159 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms