Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX5P50542 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX5P50542 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX5P50542 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX5P50542 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX5P50542 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX5P50542 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX5P50542 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX5P50542 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX5P50542 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX5P50542 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX5P50542 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX5P50542 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX5P50542 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX5P50542 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX5P50542 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX5P50542 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX5P50542 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX5P50542 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX5P50542 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX5P50542 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX5P50542 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX5P50542 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX5P50542 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX5P50542 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX5P50542 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX5P50542 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX5P50542 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX5P50542 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX5P50542 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX5P50542 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX5P50542 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX5P50542 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX5P50542 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PEX5P50542 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX5P50542 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX5P50542 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX5P50542 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX5P50542 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX5P50542 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms