Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX2P50458 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX2P50458 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX2P50458 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX2P50458 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX2P50458 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX2P50458 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX2P50458 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX2P50458 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX2P50458 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX2P50458 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX2P50458 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX2P50458 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX2P50458 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.7 ms