Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRIP1P50238 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms