Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IDH3AP50213 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IDH3AP50213 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms