Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF6P49848 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF6P49848 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF6P49848 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF6P49848 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF6P49848 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF6P49848 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF6P49848 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF6P49848 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF6P49848 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF6P49848 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF6P49848 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF6P49848 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF6P49848 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF6P49848 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF6P49848 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF6P49848 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF6P49848 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF6P49848 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF6P49848 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF6P49848 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF6P49848 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF6P49848 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF6P49848 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF6P49848 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF6P49848 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF6P49848 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF6P49848 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF6P49848 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF6P49848 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF6P49848 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF6P49848 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF6P49848 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF6P49848 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF6P49848 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF6P49848 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF6P49848 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF6P49848 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF6P49848 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF6P49848 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF6P49848 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF6P49848 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms