Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT5P48643 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT5P48643 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCT5P48643 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCT5P48643 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT5P48643 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT5P48643 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT5P48643 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT5P48643 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT5P48643 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT5P48643 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT5P48643 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT5P48643 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT5P48643 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT5P48643 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT5P48643 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT5P48643 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT5P48643 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT5P48643 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT5P48643 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT5P48643 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT5P48643 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT5P48643 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT5P48643 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT5P48643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT5P48643 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT5P48643 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms