Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XCL1P47992 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
XCL1P47992 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL1P47992 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL1P47992 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL1P47992 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
XCL1P47992 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XCL1P47992 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XCL1P47992 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XCL1P47992 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms