Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALR1P47211 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALR1P47211 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALR1P47211 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALR1P47211 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GALR1P47211 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GALR1P47211 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GALR1P47211 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GALR1P47211 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GALR1P47211 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GALR1P47211 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GALR1P47211 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms