Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSFP46459 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSFP46459 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSFP46459 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSFP46459 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSFP46459 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSFP46459 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSFP46459 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSFP46459 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSFP46459 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSFP46459 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSFP46459 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSFP46459 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSFP46459 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSFP46459 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSFP46459 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSFP46459 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSFP46459 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSFP46459 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSFP46459 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSFP46459 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSFP46459 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSFP46459 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSFP46459 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSFP46459 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSFP46459 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSFP46459 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NSFP46459 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSFP46459 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSFP46459 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSFP46459 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSFP46459 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSFP46459 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSFP46459 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSFP46459 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSFP46459 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSFP46459 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSFP46459 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms