Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSR2P43308 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR2P43308 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR2P43308 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSR2P43308 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSR2P43308 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSR2P43308 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR2P43308 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR2P43308 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR2P43308 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR2P43308 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSR2P43308 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSR2P43308 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSR2P43308 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR2P43308 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR2P43308 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR2P43308 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSR2P43308 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR2P43308 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSR2P43308 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSR2P43308 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSR2P43308 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSR2P43308 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms