Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD2P43304 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD2P43304 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD2P43304 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD2P43304 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD2P43304 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD2P43304 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD2P43304 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPD2P43304 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPD2P43304 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPD2P43304 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPD2P43304 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPD2P43304 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPD2P43304 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPD2P43304 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPD2P43304 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD2P43304 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPD2P43304 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPD2P43304 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPD2P43304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPD2P43304 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD2P43304 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD2P43304 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD2P43304 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD2P43304 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPD2P43304 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD2P43304 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD2P43304 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD2P43304 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPD2P43304 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD2P43304 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD2P43304 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD2P43304 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD2P43304 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPD2P43304 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms