Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3CBP42338 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3CBP42338 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CBP42338 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms