Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB10P40306 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB10P40306 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms