Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2IP36954 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2IP36954 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2IP36954 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms