Protein–RNA interactions for Protein: P36382

GJA5, Gap junction alpha-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA5P36382 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA5P36382 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA5P36382 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA5P36382 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA5P36382 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA5P36382 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA5P36382 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA5P36382 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA5P36382 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA5P36382 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA5P36382 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA5P36382 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GJA5P36382 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA5P36382 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJA5P36382 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA5P36382 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA5P36382 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA5P36382 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA5P36382 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA5P36382 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA5P36382 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA5P36382 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA5P36382 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA5P36382 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJA5P36382 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA5P36382 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA5P36382 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA5P36382 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA5P36382 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA5P36382 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJA5P36382 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA5P36382 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA5P36382 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA5P36382 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA5P36382 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA5P36382 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA5P36382 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA5P36382 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA5P36382 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA5P36382 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJA5P36382 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA5P36382 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA5P36382 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA5P36382 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA5P36382 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA5P36382 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA5P36382 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA5P36382 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms