Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L1P36222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHI3L1P36222 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L1P36222 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms