Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYH11P35749 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYH11P35749 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYH11P35749 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYH11P35749 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYH11P35749 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYH11P35749 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYH11P35749 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYH11P35749 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYH11P35749 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYH11P35749 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYH11P35749 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYH11P35749 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYH11P35749 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYH11P35749 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYH11P35749 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYH11P35749 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYH11P35749 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
MYH11P35749 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
MYH11P35749 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYH11P35749 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYH11P35749 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYH11P35749 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYH11P35749 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MYH11P35749 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYH11P35749 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYH11P35749 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYH11P35749 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYH11P35749 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms