Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT9P35527 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT9P35527 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT9P35527 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT9P35527 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT9P35527 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT9P35527 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT9P35527 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT9P35527 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT9P35527 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT9P35527 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT9P35527 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT9P35527 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT9P35527 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT9P35527 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT9P35527 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT9P35527 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT9P35527 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT9P35527 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT9P35527 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT9P35527 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT9P35527 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT9P35527 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms