Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXD13P35453 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD13P35453 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD13P35453 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms