Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNA1P35221 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNA1P35221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNA1P35221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms