Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH5P33151 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH5P33151 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH5P33151 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH5P33151 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH5P33151 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH5P33151 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH5P33151 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH5P33151 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH5P33151 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH5P33151 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH5P33151 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH5P33151 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH5P33151 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH5P33151 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH5P33151 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH5P33151 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH5P33151 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH5P33151 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH5P33151 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH5P33151 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH5P33151 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH5P33151 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH5P33151 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH5P33151 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH5P33151 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH5P33151 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH5P33151 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH5P33151 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH5P33151 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH5P33151 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH5P33151 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH5P33151 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH5P33151 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH5P33151 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH5P33151 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH5P33151 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms