Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCR5P32302 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR5P32302 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms