Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-FP30511 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-FP30511 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-FP30511 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms