Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRABP1P29762 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRABP1P29762 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRABP1P29762 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms