Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMOD1P29536 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMOD1P29536 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMOD1P29536 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms