Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL4A5P29400 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL4A5P29400 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL4A5P29400 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
COL4A5P29400 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
COL4A5P29400 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL4A5P29400 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms