Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK1P29120 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCSK1P29120 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms