Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF8P28908 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF8P28908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms